Marmara Üniversitesi
Marmara Üniversitesi Eğitim-Öğretim Bilgi Sistemi

Programlar Hakkında Bilgi

Lisans - Mühendislik Fakültesi - Biyomühendislik (İngilizce)

Müfredat Adı Ders Kodu Ders Adı Ders Türü Dönem AKTS Teorik Uygulama
2023 - Biyomühendislik - Lisans BIOE3232 Introduction to Systems Biology Seçmeli 5 5,00 3 0

Dersin İçeriği

Dersin Amacı

Bu dersin amacı öğrencilere sistem biyolojisindeki güncel yöntemler, uygulamalar, analizler hakkında genel bir bakış açısı sağlamaktır.

Öğrenim Türü

-

Dersin İçeriği

Omik veri toplama ve yorumlama Sistem biyolojisi araştırmalarında kullanılan büyük ölçekli yöntemler ve temel veri türleri Avantaj ve dezavantajlarına göre farklı sistem biyolojisi yaklaşımları Ağ Biyolojisi Topolojik parametreler Biyoinformatik araçlara dayalı pratik çalışmalar Sistem biyolojisi alanında en son araştırma yayınlarından örnekler

Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları

Bilgisayar projeksiyonu ile sunulan dersler Okuma ödevleri

Staj Durumu

Yok

Dersin Sunulduğu Dil

İngilizce

Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar

Systems Biology in Practive, Klipp-Herwig-Kowald-Wierling-Lehrach, Wiley, 2005;Uri Alon, “Introduction to Systems Biology: Design Principles of Biological Circuits,” CRC Press, 2006 Ders notları

Dersin Web Sayfası

-

Öğrenme Çıktıları

  • Sistem bazlı analizler ve yüksek hacimli verilerle ilgili temel bilgiye sahip olmak
  • Omik veri eldesinde kullanılan deneysel teknikleri ve hesapsal analiz yöntemlerinin öğrenilmesi
  • Durum çalışmalarının yardımı ile sistem biyolojisi uygulamalarına aşina olmak
  • Sistem biyolojisi, ağ biyolojisi, topoloji, metabolik model gibi tanımların öğrenilmesi

Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği

Hafta Teorik
1 Hücre Biyolojisine Giriş
2 Biyolojik moleküller: Genler, proteinler, metabolitler
3 Sistem Biyolojisinin Temelleri
4 Omik Veriler- Genomiks
5 Omik Veriler- Transkriptomiks
6 Omik Veriler- Proteomiks
7 Omik Veriler- Metabolomiks
8 Ara Sınav
9 Ağ biyolojisi-1
10 Ağ biyolojisi-2
11 Veri seti tarama ve gen ekspresyonu değişen genleri bulma
12 Protein-protein etkileşim ağlarının oluşturulması
13 Fonksiyonel zenginleştirme analizleri
14 İlaç yeniden konumlandırma
15 Proje sunumları
16 Final Sınavı
17

Değerlendirme

Değerlendirme Değer
Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri 60
Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri 40
Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri Değer
Final Sınavı 100

Öğrenci İş Yükü Hesabı

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ders Öncesi/Sonrası Bireysel Çalışma 10 5 50
Proje ve Hazırlığı 0 0 0
Ödev ve Hazırlığı 0 0 0
Laboratuvar ve Hazırlığı 0 0 0
Atölye ve Hazırlığı 0 0 0
Sunum ve Hazırlığı 1 6 6
Seminer ve Hazırlığı 0 0 0
Demo ve Hazırlığı 0 0 0
Araştırma ve Hazırlığı 0 0 0
Rapor ve Hazırlığı 0 0 0
Arasınav ve Hazırlığı 1 6 6
Kısa Sınav ve Hazırlığı 0 0 0
Final ve Hazırlığı 1 6 6
Teorik Ders Saati 15 3 45
Uygulama Ders Saati 0 0 0

Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi

ÖÇ1
ÖÇ2
ÖÇ3
ÖÇ4
ÖÇ5