Marmara Üniversitesi
Marmara Üniversitesi Eğitim-Öğretim Bilgi Sistemi

Programlar Hakkında Bilgi

Doktora - Fen Bilimleri Enstitüsü - Kimya

Müfredat Adı Ders Kodu Ders Adı Ders Türü Dönem AKTS Teorik Uygulama
Kimya-Organik Kimya- Doktora - 2014 KMYR7015 Bilgisayar Destekli İlaç Tasarımı Seçmeli 1 8,00 3 0

Dersin İçeriği

Dersin Amacı

Günümüzde akılcı ilaç tasarım süreçleri çeşitli bilgisayar programlarının kullanılmasını zorunlu hale getirmiştir. Bu dersin amacı, molekül modelleme ve kim-informatik yöntemlerin akılcı ilaç tasarımında nasıl kullanıldığını örnek uygulamalarla göstermektir.

Öğrenim Türü

-

Dersin İçeriği

Akılcı ilaç tasarımı, geliştirilmesinin safhaları, enzimler, ilaç-enzim etkileşimleri, Öncü bileşik, farmakofor gruplar, ADMET, lagand-temelli ve yapı-temelli ilaç tasarımı, QSAR, farmakofor modelleme, moleküler doking

Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları

Ders anlatımı, tartışma, makale inceleme, proje, sunum

Staj Durumu

-

Dersin Sunulduğu Dil

Türkçe

Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar

Organic Chemistry of Drug Design and Action, R. B. Silverman Medicinal chemistry, Graham Patrick. Essentials of Computational Chemistry, C. J. Cramer

Dersin Web Sayfası

-

Öğrenme Çıktıları

  • İlaç-reseptör etkileşimlerini tanır ve ayır eder.
  • İlaç tasarımında kullanılan terimleri ve yöntemleri bilir.
  • Farmakofor gruplarını ayırt eder.
  • Bilgisayarda ADME özelliklerini tahmin ettirtebilir.
  • Bilgisayarda enzim-ligand doking hesaplaması yapabilir, sonuçlarını yorumlayabilir.

Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği

Hafta Teorik
1 Giriş ve önemli terimlerin tanımları
2 Katalizör olarak enzimlerin işlevi
3 Bir enzimi niye inhibe edilir?
4 İlaç-reseptör etkileşimleri İlaç-reseptör etkileşimleri İlaç-reseptör etkileşimleri
5 İlaç keşfi, tasarımı ve geliştirilmesi
6 Öncü bileşik keşfi ve modifikasyonu
7 Molekül modelleme ve ilaç tasarımı
8 Ara Sınav Haftası
9 2D/3D tarama, farmakofor modelleme
10 Liganda dayalı ilaç tasarımı, QSAR modelleri
11 Model validasyonu, uygulanabilirlik alanı
12 Yapıya-dayalı ilaç tasarımı
13 Moleküler doking
14 ADMET özellikleri
15 Proje sunumları
16 Ders Çalışma Haftası
17 Yarı Yıl Sonu Sınavı

Değerlendirme

Değerlendirme Değer
Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri 50
Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri 50
Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri Değer
Final Sınavı 100

Öğrenci İş Yükü Hesabı

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ders Öncesi/Sonrası Bireysel Çalışma 15 3 45
Proje ve Hazırlığı 1 30 30
Ödev ve Hazırlığı 1 20 20
Sunum ve Hazırlığı 1 10 10
Rapor ve Hazırlığı 2 20 40
Arasınav ve Hazırlığı 1 20 20
Final ve Hazırlığı 1 30 30

Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi

ÖÇ1
ÖÇ2
ÖÇ3
ÖÇ4
ÖÇ5