| Müfredat Adı | Ders Kodu | Ders Adı | Ders Türü | Dönem | AKTS | Teorik | Uygulama |
| 2017 - Tıbbi Genetik | TGEN7008 | Bioinformatiğe Giriş | Seçmeli | 1 | 8,00 | 3 | 0 |
Marmara Üniversitesi
Marmara Üniversitesi Eğitim-Öğretim Bilgi Sistemi
Programlar Hakkında Bilgi
Tezli Yüksek Lisans - Sağlık Bilimleri Enstitüsü - Tıbbi Genetik
Dersin İçeriği
Dersin Amacı
Temel Biyoinformatik analiz yöntemlerinin uygulamalı olarak öğrenilmesi
Öğrenim Türü
-
Dersin İçeriği
Terminoloji, Genom yapısı, Bilgi kaynakları ağları, Genom bilgi kaynakları, Protein bilgi kaynakları, Sekans analizi temel prensipleri, Hizalama teknikleri (çiftli, çoklu),
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Sekonder bilgi bankası tarama, Dizi tarama protokolü oluşturma (Pratik)
Staj Durumu
Gerçek datalar üzerinde analiz pratiği
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
BIOINFORMATICS AND FUNCTIONAL GENOMICS- Pevsner
Dersin Web Sayfası
-
Öğrenme Çıktıları
- Biyoinformatik analiz
- Dizi bilgilerinin genomda hizalanması
- Gen veri bankalarının etkin kullanımı
- Dizileme sonuçlarının genom verileri ile karşılaştırılması
- Vaka bazlı biyoinformatik analizlerin yapılması
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Teorik |
|---|---|
| 1 | Terminoloji, |
| 2 | Genom yapısı, |
| 3 | Bilgi kaynakları ağları, |
| 4 | Protein bilgi kaynakları, |
| 5 | Sekans analizi temel prensipleri, |
| 6 | Genom bilgi kaynakları, |
| 7 | Sekonder bilgi bankası tarama, |
| 8 | Dizi tarama protokolü oluşturma |
| 9 | Primer düzenleme ve assay tasarlama |
| 10 | BLAST analizi |
| 11 | Hizalama Teknikleri (Alignment) (çiftli, çoklu), |
| 12 | RNA data |
| 13 | NCBI bilgi bankası |
| 14 | ENSEMBL bilgi bankası |
| 15 | NGS dizileme sonuçlarının genom verileri ile karşılaştırılması |
| 16 | Vaka Tartışması |
| 17 | Final Değerlendirmesi |
Değerlendirme
| Değerlendirme | Değer |
|---|---|
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Değer |
| Final Sınavı | 100 |
Öğrenci İş Yükü Hesabı
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ders Öncesi/Sonrası Bireysel Çalışma | 2 | 6 | 12 |
| Proje ve Hazırlığı | 1 | 2 | 2 |
| Ödev ve Hazırlığı | 2 | 3 | 6 |
| Laboratuvar ve Hazırlığı | 0 | 0 | 0 |
| Atölye ve Hazırlığı | 0 | 0 | 0 |
| Sunum ve Hazırlığı | 12 | 3 | 36 |
| Seminer ve Hazırlığı | 1 | 3 | 3 |
| Demo ve Hazırlığı | 1 | 1 | 1 |
| Araştırma ve Hazırlığı | 2 | 3 | 6 |
| Rapor ve Hazırlığı | 2 | 4 | 8 |
| Arasınav ve Hazırlığı | 2 | 6 | 12 |
| Kısa Sınav ve Hazırlığı | 2 | 6 | 12 |
| Final ve Hazırlığı | 2 | 10 | 20 |
| Teorik Ders Saati | 12 | 3 | 36 |
| Uygulama Ders Saati | 12 | 3 | 36 |