| Müfredat Adı | Ders Kodu | Ders Adı | Ders Türü | Dönem | AKTS | Teorik | Uygulama |
| Biyoloji - Lisans - 2014 | BYL4037 | Genomik ve Proteomik | Seçmeli | 3 | 4,00 | 2 | 0 |
Marmara Üniversitesi
Marmara Üniversitesi Eğitim-Öğretim Bilgi Sistemi
Programlar Hakkında Bilgi
Lisans - Fen-Edebiyat Fakültesi - Biyoloji
Dersin İçeriği
Dersin Amacı
Bu dersin amacı çeşitli organizmalarda genom yapısının karşılaştırılarak öğrenilmesi, fonksiyonel genomik, farmakogenomik, nutrigenomik, metabolomik, protein- protein etkileşimi, protein- genom etkileşimi, postranslasyonel proteomik uygulamaların kavranması.
Öğrenim Türü
-
Dersin İçeriği
Prokaryotik ve Ökaryotik genomları, karşılaştırmalı genomik Fonkisyonel Genomik uygulamalarda kullanılan teknik ve stratejiler İnsan genetik hastalıklarında kullanılan omik uygulamalar Farmakogenetik, farmakogenomik ve uygulamaları Toksikogenomik ve uygulamaları Nutrigenomik ve uygulamaları Metabolomik ve uygulamaları Proteomiğin , genomik ve sistem biyolojisi ile ilişkisi Proteomikte deneysel stratejiler, jel bazlı ayırıcı, protein/peptidlerin jelde görüntülenmesi, proteomik uygulamalarda mikroçipler Proteomikte protein modifikasyonları, protein-protein etkileşimlerinin incelenmesi Kütle spektroskopi analizi ve uygulama alanları Mikroçip teknolojisinde son gelişme ve uygulamalar Omik teknolojisinin tedavideki yeri Omik teknolojisinde biyoinformatik yaklaşımlar
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Ders anlatımı, dersleri destekleyici nitelikteki okuma materyali, video materyali yada ppt sunumu gösterme, sorun/problem çözme, rapor hazırlama ve sunma ve beyin fırtınası yöntemleri uygulanacaktır.
Staj Durumu
Yok
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
Essentials of Genomic and Personalized Medicine, Geoffrey S. Ginsburg (Editor), Huntington Ph.D Willard (Editor), Academic Press; 1 edition, 2009. Genomics: Applications in Human Biology Sandy B. Primrose (Author), Richard Twyman (Author), Wiley-Blackwell; 1 edition, February 9, 2004. Introducing Proteomics: From concepts to sample preparation, mass spectrometry and data analysis, josip Lovric, Wiley-Blackwell, 2011 Proteomics in Practice: A guide to successful experimental design. Reiner Westermeier, Tom Naxen, Hans-Rudolf Höpker, Wiley-VCH, 2008
Dersin Web Sayfası
-
Öğrenme Çıktıları
- Karşılaştırmalı genomik
- Genomik uygulamalarda kullanılan yöntemlerin öğrenilmesi ile genomik uygulama alanlarının kavranabilinmesi
- Farmakogenomik, nutrigenomik gibi alanlardaki problemlerin analiz edilmesi ve genomik uygulama yöntemleri
- Proteomik yaklaşımların tanımlanması ve protein yapı ve fonksiyonlarının araştırılmasına uyarlanması
- Klasik ve güncel proteomik yaklaşımlar ile protein yapılarının kıyaslanması
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Teorik |
|---|---|
| 1 | Prokaryotik ve Ökaryotik genomları, karşılaştırmalı genomik |
| 2 | Fonkisyonel Genomik uygulamalarda kullanılan teknik ve stratejiler |
| 3 | İnsan genetik hastalıklarında kullanılan omik uygulamalar |
| 4 | Farmakogenetik, farmakogenomik ve uygulamaları |
| 5 | Toksikogenomik ve uygulamaları |
| 6 | Nutrigenomik ve uygulamaları |
| 7 | Metabolomik ve uygulamaları |
| 8 | Ara Sınav Haftası |
| 9 | Proteomiğin , genomik ve sistem biyolojisi ile ilişkisi |
| 10 | Proteomikte deneysel stratejiler, jel bazlı ayırıcı, protein/peptidlerin jelde görüntülenmesi, proteomik uygulamalarda mikroçipler |
| 11 | Proteomikte protein modifikasyonları, protein-protein etkileşimlerinin incelenmesi |
| 12 | Kütle spektroskopi analizi ve uygulama alanları |
| 13 | Mikroçip teknolojisinde son gelişme ve uygulamalar |
| 14 | Omik teknolojisinin tedavideki yeri |
| 15 | Omik teknolojisinde biyoinformatik yaklaşımlar |
| 16 | Ders Çalışma Haftası |
| 17 | Yarı Yıl Sonu Sınavı |
Değerlendirme
| Değerlendirme | Değer |
|---|---|
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Değer |
| Final Sınavı | 100 |
Öğrenci İş Yükü Hesabı
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ders Öncesi/Sonrası Bireysel Çalışma | 14 | 5 | 70 |
| Proje ve Hazırlığı | 0 | 0 | 0 |
| Ödev ve Hazırlığı | 1 | 5 | 5 |
| Laboratuvar ve Hazırlığı | 0 | 0 | 0 |
| Atölye ve Hazırlığı | 0 | 0 | 0 |
| Sunum ve Hazırlığı | 0 | 0 | 0 |
| Seminer ve Hazırlığı | 0 | 0 | 0 |
| Demo ve Hazırlığı | 0 | 0 | 0 |
| Araştırma ve Hazırlığı | 0 | 0 | 0 |
| Rapor ve Hazırlığı | 0 | 0 | 0 |
| Arasınav ve Hazırlığı | 1 | 10 | 10 |
| Kısa Sınav ve Hazırlığı | 0 | 0 | 0 |
| Final ve Hazırlığı | 1 | 20 | 20 |
| Teorik Ders Saati | 0 | 0 | 0 |
| Uygulama Ders Saati | 0 | 0 | 0 |
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| ÖÇ1 | |||||||||||||||||
| ÖÇ2 | |||||||||||||||||
| ÖÇ3 | |||||||||||||||||
| ÖÇ4 | |||||||||||||||||
| ÖÇ5 |