Marmara Üniversitesi
Marmara Üniversitesi Eğitim-Öğretim Bilgi Sistemi

Programlar Hakkında Bilgi

Tezli Yüksek Lisans - Fen Bilimleri Enstitüsü - Kimya

Müfredat Adı Ders Kodu Ders Adı Ders Türü Dönem AKTS Teorik Uygulama
Kimya-Organik Kimya - Yüksek Lisans - 2014 KMYR7013 Hesapsal Organik Kimya Seçmeli 1 8,00 3 0

Dersin İçeriği

Dersin Amacı

Kimyanın çeşitli alanlarındaki güncel araştırmalarda sıkça kullanılan hesapsal kimya yöntemlerini tanıtmak, bilgisayar başında birfiil molekül modelleme uygulamaları yaptırarak bu yöntemlerin organik kimyada çeşitli amaçlar için nasıl kullanılabileceğini öğretmek.

Öğrenim Türü

-

Dersin İçeriği

Hesapsal yöntemlere giriş, kuantum kimyasal hesaplamalar; Ab initio yöntemleri, HF ve UHF modelleri, SCF teorisi; Yarı-deneysel ve DFT yöntemleri; Z-Matris hazırlama, Geometri optimizasyonu ve enerji minimizasyonu; Reaksiyon termokimyası, Reaktivite ve seçicilik, Kinetik ve termodinamik kontrol, Hammond postulate.

Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları

Ders anlatımı, tartışma, bilgisayarda uygulama, uygulama ödevleri, rapor hazırlama

Staj Durumu

-

Dersin Sunulduğu Dil

Türkçe

Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar

Ab initio Molecular Orbital Theory, W. J. Hehre, L. Radom, P. Schleyer, J. A. Pople, Wiley, 1986. Essentials of Computational Chemistry, C. J. Cramer, 2nd addition, Wiley, 2004 Experiments in Computational Organic Chemistry, W. Hehre, L. D. Burke, A. J. Shusterman, W. J. Pietro, Wavefunction Inc., 1993. Hesapsal Organik Kimya Ders Notları, Safiye Erdem, 2007 Spartan manual, Wavefunction, 2004.

Dersin Web Sayfası

http://mimoza.marmara.edu.tr/~erdem/

Öğrenme Çıktıları

  • Hesaplamalı kimya yöntemlerini tanır ve ayırt eder.
  • Hesaplama yöntemlerinin avantaj ve dezavantajlarını bilir.
  • Girdileri hazırlayın ve reaksiyon mekanizmalarını modellemek için kuantum kimyası bilgisayar programlarını kullanın. Girdileri hazırlayın ve reaksiyon mekanizmalarını modellemek için kuantum kimyası bilgisayar programlarını kullanın. Girdileri hazırlayın ve reaksiyon mekanizmalarını modellemek için kuantum kimyası bilgisayar programlarını kullanın. kuantum kimyası bilgisayar programlarının girdilerini hazırlar, molekülleri ve tepkimeleri modellemek için kullanır.
  • Kimyasal yapıları, grafikleri, tabloları çizmek için bilgisayar kullanır.
  • Bilimsel raporlar yazar.

Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği

Hafta Teorik
1 Hesapsal yöntemlere giriş, kuvantum kimya hesaplamaları
2 Ab initio MO yöntemleri, HF ve UHF modelleri, SCF metodu
3 Yarı-ampirik yöntemler, DFT yöntemleri
4 Paket programların tanıtımı (MOPAC, SPARTAN, GAUSSIAN), programlara nasıl input hazırlanır?
5 Z-matris inputu hazırlama, geometri optimizasyonu ve enerji minimizasyonu uygulamaları
6 UYGULAMA 1: Sübstitüe siklohekzanların konformasyonel analizi
7 Konformasyonel ve stereoelektronik etkiler (Gauche etkisi, anomerik etki, bağsız etkileşimler, vs.)
8 Ara Sınav Haftası
9 UYGULAMA 2: Bütanın konformasyonel analizi
10 Potansiyel enerji yüzeyleri, yerel ve global minimumlar, geçiş konumları, frekans hesapları
11 UYGULAMA 3: 1,2-Etandiol'ün potansiyel enerji yüzeyi
12 Reaksiyon termokimyası, reaktiflik ve seçicilik
13 UYGULAMA 4: Olefinlerde hidroborasyonun bölge seçiciliği
14 Kinetik ve termodinamik kontrol, Hammond postülatı
15 UYGULAMA 5: Etilene singlet diflorokarben katılması
16 Ders Çalışma Haftası
17 Yarı Yıl Sonu Sınavı

Değerlendirme

Değerlendirme Değer
Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri 50
Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri 50
Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri Değer
Final Sınavı 100

Öğrenci İş Yükü Hesabı

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ders Öncesi/Sonrası Bireysel Çalışma 15 3 45
Ödev ve Hazırlığı 5 20 100
Arasınav ve Hazırlığı 1 20 20
Final ve Hazırlığı 1 30 30

Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi

ÖÇ1
ÖÇ2
ÖÇ3
ÖÇ4
ÖÇ5