| Müfredat Adı | Ders Kodu | Ders Adı | Ders Türü | Dönem | AKTS | Teorik | Uygulama |
| Tıbbi Biyoloji ve Genetik - Doktora - 2014 | GEN8014 | Moleküler Biyolojide Biyoinformatik Uygulamalar | Seçmeli | 1 | 7,50 | 3 | 0 |
Marmara Üniversitesi
Marmara Üniversitesi Eğitim-Öğretim Bilgi Sistemi
Programlar Hakkında Bilgi
Doktora - Sağlık Bilimleri Enstitüsü - Tıbbi Biyoloji ve Genetik
Dersin İçeriği
Dersin Amacı
Moleküler biyoloji ve Genetik alanındaki biyoinformatik uygulamalar hakkında bilgi sahibi olmak ve bunları uygulayabilmektir.
Öğrenim Türü
-
Dersin İçeriği
Biyoinformatik biyolojik verilerin işlenmesi veya biyolojik problemlerin çözümünde bilgisayar bilimleri, matematik ve istatistiğin kullanıldığı bir alandır. Günümüzde özellikle moleküler biyoloji alanındaki biyoinformatik uygulanalar ön plana çıkmaktadır. Biyoinformatikte analiz edilen verilerin çoğu DNA veya RNA nükleotidlerinin veya bir proteindeki amino asitlerin dizilerinden oluşmaktadır.
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Sunum tarzı dersler, makale çözümlemeleri ve probleme dayalı öğrenme oturumları
Staj Durumu
Staj durumu bulunmamaktadır
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
Moleculer biotechnology, principles and applications, Bernard Glick
Dersin Web Sayfası
-
Öğrenme Çıktıları
- Moleküler biyoloji alanında en sık kullanılan biyoinformatik uygulamaları listeleyebilmek,
- DNA/RNA/Protein düzeyinde kullanılan software’ler ve web-tabanlı uygulamaları kullanabilmek,
- Güncel online veritabanlarını bilmek ve kullanımı hakkında bilgi sahibi olmak,
- İleri düzey moleküler biyoloji ve genetik konularını sınıflandırabilmek.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Teorik |
|---|---|
| 1 | Giriş |
| 2 | Gen haritalama |
| 3 | Genom dizileme |
| 4 | Genom analiz veri tabanları |
| 5 | Genom analiz veri tabanlarının kullanımı |
| 6 | Gen ekspresyon analizleri |
| 7 | Transkriptom verileri |
| 8 | Transkriptom veri yorumlanması |
| 9 | Ara sınav |
| 10 | Yolak analizleri |
| 11 | Protein yapı tahmini/modelleme |
| 12 | Protein etkileşimleri |
| 13 | Protein/protein, protein/DNA/RNA etkileşimleri |
| 14 | Filogenetik |
| 15 | Ders çalışma haftası |
| 16 | Yarıyıl sonu sınavı |
| 17 |
Değerlendirme
| Değerlendirme | Değer |
|---|---|
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Değer |
| Final Sınavı | 100 |
Öğrenci İş Yükü Hesabı
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ders Öncesi/Sonrası Bireysel Çalışma | 3 | 11 | 33 |
| Proje ve Hazırlığı | 2 | 10 | 20 |
| Ödev ve Hazırlığı | 2 | 10 | 20 |
| Laboratuvar ve Hazırlığı | 0 | 0 | 0 |
| Atölye ve Hazırlığı | 0 | 0 | 0 |
| Sunum ve Hazırlığı | 2 | 9 | 18 |
| Seminer ve Hazırlığı | 1 | 0,5 | 0,5 |
| Demo ve Hazırlığı | 0 | 0 | 0 |
| Araştırma ve Hazırlığı | 2 | 10 | 20 |
| Rapor ve Hazırlığı | 1 | 10 | 10 |
| Arasınav ve Hazırlığı | 1 | 16 | 16 |
| Kısa Sınav ve Hazırlığı | 0 | 0 | 0 |
| Final ve Hazırlığı | 1 | 20 | 20 |
| Teorik Ders Saati | 10 | 3 | 30 |
| Uygulama Ders Saati | 0 | 0 | 0 |
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| ÖÇ1 | ||||||||||
| ÖÇ2 | ||||||||||
| ÖÇ3 | ||||||||||
| ÖÇ4 | ||||||||||
| ÖÇ5 |